عفونت‌ها بیشتر در شرایط بهداشتی نامناسب و با مصرف غذا یا آب آلوده منتقل می‌شوند. عفونت‌ها همچنین می‌توانند از طریق تماس مستقیم و یا با استفاده از دستگاه‌های بخور از فردی به فرد دیگر منتقل شوند. اولین بار در سال ۲۰۰۲، دوره فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان در پردیس کلینیک مایو در روچستر (ایالات مینه سوتا آمریکا) معتبر شناخته شد. اهداف این دوره حداکثری از وسعت فرصت‌های آموزشی در زمینه‌های بیماری‌زایی میکروبی، ویروس‌شناسی، انگلی، ایمونوبیولوژی، واکسینولوژی، اپیدمیولوژی بیمارستان، مدیریت اقدامات ضد میکروبی و بهداشت بین الملل با توجه به نیاز کودکان است. توجه داشته باشید
علاوه بر آموزش بالینی و تحقیقاتی پزشکان در دوره فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان، آن‌ها تجربه کاملی در زمینه‌های آزمایشگاه میکروبیولوژی، ویروس‌شناسی بالینی، رتروویروس، طب گرمسیری، سل، بیماریهای عفونی پیوند، و همکاری در تیم‌های کنترل عفونت و سرپرستی تیم‌های ضد میکروبی در این دوره کسب می‌کنند.
یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان، باید بیمارانی با طیف وسیعی از بیماریهای عفونی و نقص ایمنی ویزیت می‌کنند. بیماران ممکن است به دلایل زیادی به انواع بیماریهای مختلف مبتلا شده باشند، مانند در معرض قرار گرفتن از جمله نقص ایمنی اولیه، فرایندهای آنکولوژیک، پیوند سلول‌های بنیادی یا اندام اصلی بدن، مواجهه درمانی بیولوژیکی، عوارض جراحی و یا نتیجه سفرهای بین المللی داشته باشند. یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان باید توانایی ایجاد یک افتراقی گسترده (عفونی و غیر عفونی) و ارائه توصیه‌های مبتنی بر شواهد را برای ارزیابی و مدیریت شرایط هر بیمار را داشته باشد. همچنین نباید فراموش کنیم که کودکان همانند بزرگسالان، توانایی درک و توضیح شرایط خود را ندارند. همچنین کودکان بیمار به شدت ناآرام بوده و مدیریت یک کودک بیمار، توانایی خاصی را می‌طلبد. جذب دارو همچنین به آنزیم‌های خاصی بستگی دارد که هنگام عبور از بدن با داروی خوراکی تماس پیدا می‌کنند. با ادامه رشد دستگاه گوارش در کودکان، تأمین این آنزیم‌ها افزایش می‌یابد؛ لذا مهارت مناسب در تعیین درست دوز دارو به شدت در روند بهبود بیماران مبتلا به بیماریهای عفونی بسیار مهم است.
لازم به ذکر است که یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان باید در زمینه‌های؛ میکروبیولوژی بالینی و تشخیصی، ویروس‌شناسی، ایمونولوژی، اپیدمیولوژی، آمار زیستی، طراحی تحقیق در زمینه‌های بررسی بیشتری بیماریهای عفونی، پیشگیری و کنترل عفونت تجربیات ایمنی‌شناسی بالینی، داروسازی کودکان، مدیریت اقدامات ضد میکروبی و همچنین بهداشت عمومی تسلط داشته باشد.
مهارتهای تحقیقاتی و بالینی که یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان که در طی دوره فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان به دست می‌آورد، وی را به عنوان گزینه‌ای مناسب برای رقابت به دست آوردن بودجه تحقیقاتی در مطالعات بالینی، آماده و متمایز می‌کند. همچنین یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان در تدریس تسلط پیدا می‌کنند و تشویق می‌شوند مهارتهای رهبران آینده در این زمینه را گسترش دهند. انتظار می‌رود که یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان در برنامه آماده‌سازی ضد میکروبی بیمارستان، نیز نقش مهمی داشته باشد.
یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان در معرض عمیق میکروبیولوژی، ویروس‌شناسی، ایمونولوژی، اپیدمیولوژی، فارماکولوژی بالینی، مهار آنتی بیوتیک و پیشگیری و کنترل عفونت قرار می‌گیرد زیرا این موارد مربوط به مراقبت از بیمار، آموزش پیشگیری و درمان بیماریهای عفونی است. در نتیجه یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان در معرض انواع بیماری به شدت واگیر دار ویروسی، باکتریایی و قارچی قرار دارد. لذا یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان باید در تمام مراحل معاینه، تشخیص و درمان بیماران بیشترین احتیاط را داشته باشد.
روند مراجعه به یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان معمولا، با توجه به توصیه دکتر عمومی یا متخصص اطفال و کودکان شروع می‌شود. اما باید داشته باشید که اگر کود شما در معرض ابتلا به بیماریهای حاد عفونی، ویروسی یا قارچی قرار می‌گیرد؛ مانند در معرض ابتلا بیماری ایدز (HIV) فورا باید به یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان مجرب مراجعه کنید. زمان در چنین شرایط بسیار مهم است و اتلاف اصلا توجیه ندارد. همچین تب بالای کودکان نشانه مهمی در برای مراجعه به یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان است. در زمانی که خطر ابتلا بیماری ایدز از طریق مادر به جنین وجود دارد نقش یک فوق تخصص بیماریهای عفونی کودکان در تیم درمان و زایمان کودک به شدت مهم است.
در ایران، دانشجویان پزشکی می‌توانند بعد از گذراندن دوره‌های پزشکی عمومی، که یک دوره هفت‌ساله است می‌توانند با ورود به دوره تخصصی چهارساله در دانشکده‌های پزشکی مدرک تخصصی اطفال و کودکان را دریافت کنند و به پزشکی که در حال طی این دوره است را رزیدنت می‌گویند. در نهایت بعضی از متخصصان اطفال و کودکان سعی می‌کنند با ورود به دوره فوق تخصصی بیشترین تمرکز خود را در یک زمینه بگذارند تا علم و تجربه بیشتری را در آن زمینه کسب کنند. یکی از زیر شاخه‌های اصلی دوره فوق تخصص اطفال و کودکان، تخصص بیماریهای عفونی کودکان است
کانون تشخیص سریع بیماریهای عفونی کودکان در دهه اخیر از تغییر روشهای آزمایشگاهی مرسوم تشخیص آنتی ژن، میکروسکوپ و بررسی فرهنگ هر خانواده در امور بهداشتی به سمت تشخیص مولکولی عوامل عفونی تغییر یافته است. متخصصان اطفال باید قادر به استفاده، درک محدودیت‌ها و بررسی نتایج تکنیک‌های تشخیص مولکولی باشند زیرا به طور فزاینده‌ای در پروتکل‌های آزمایشگاهی میکروب‌شناسی بالینی معمول ادغام شده است. لازم به ذکر است که آزمایشی تشخیصی هر بیماری عفونی می‌تواند متفاوت باشد. مثلا بیماریهای عفونی دستگاه گوارش که در سراسر جهان بسیار شایع است و یکی از دلایل مهم مرگ و میر این بیماری است، به ویژه در نوزادان در کشورهای در حال توسعه است. اسهال و سایر عفونت‌های روده‌ای توسط طیف وسیعی از باکتری‌ها، ویروس‌ها، پروتوزوئا و انگلی ایجاد می‌شوند. تشخیص متعارف این عفونت‌ها توسط کشت، میکروسکوپ و آزمایش‌های ایمنی سنجش آنتی ژن انجام می‌شود.
